Po Viedenskej arbitráži odišla väčšina slovenských seminaristov študovať teológiu do Bratislavy a Spišskej Kapituly. Tí ktorí zostali, dokončili svoje štúdium v latinčine. Kňazský seminár (Biskupská teologická vysoká škola) na Hlavnej ulici č. 89 a v rámci neho zriadený Katolícky učiteľský ústav, sídliaci na Kováčskej ulici č. 48, predstavovali hlavné cirkevné vzdelávacie inštitúcie v meste.
Miesto rektora zastával najprv Dr. Rudolf Prónai a neskôr Dr. Béla (Vojtech) Wick. Vicerektorom bol Dr. Zoltán Antal, spirituálom Dr. Melichar Zelený, študijným prefektom Dr. Pál Brezanóczy.
Medzi ďalších pedagógov patrili: Dr. Emil Sebeczky, Dr. József Nagy, Dr. László Hévey, Dr. Francesco Marino Marioli a tiež Dr. Anton Harčar, ktorý bol za svoju proslovenskú politiku v Slovenskom katolíckom kruhu a svoje sympatie k Strane slovenskej národnej jednoty odvolaný z funkcie.