Transfer vedomostí sa uskutočňoval prostredníctvom študentov z Košíc, ktorí v neskorom stredoveku navštevovali stredoeurópske univerzity (Krakov, Prahu, Viedeň) a talianske univerzity.
V ranom novoveku sa akademická peregrinácia Košičanov počas prebiehajúcej reformácie zamerala najmä na nemecké univerzity. V kontexte požiadavky Tridentského koncilu na vzdelávanie kňazov uvažoval o založení univerzity v Košiciach pápežský legát Antonio Possevino počas svojej návštevy Košíc v roku 1583, neskôr presadzoval ideu založenia univerzity v Košiciach ostrihomský arcibiskup Peter Pázmaň.
